单个设计产品开发项目确切地说可生成上百个与设计相关的文档。在开发过程中每个文档都会有许多版本。设计复杂性增加时，系统跟踪和控制设计文档存储和版本的需要也随之增加。越来越多的机构实施了文档版本控制系统以管理这一流程。
Altium Designer提供广泛的多功能支持，可链接到外部版本控制系统，也可在本地跟踪设计文档的历史。Altium Designer可与支持源代码控制接口（SCCI）、并发版本系统（CVS）或子版本（SVN）标准的任意第三方版本控制系统做接口，包括诸如Microsoft Visual SourceSafe这样的商用系统和大多数流行的开源版本控制应用
在Altium Designer中用户可添加设计文档到版本控制系统中任意指定库中，执行所有通用版本控制任务，如文档更新和给版本做标签。用户无需离开Altium Designer环境即可管理文档。
即使机构中没有完全的版本控制系统在运行，Altium Designer也可以方便地在本地跟踪项目的文档历史。每当用户保存文件时，Altium Designer都会自动保存原文件的副本，创建文档更新的完整历史。用户可以对重要版本做标签，添加注释到历史文件以记录改变。
Altium Designer完全支持外部文档版本控制和本地文档历史管理，具有处理重要设计文档的灵活性和安全性。